Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PLXNA3P51805 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PLXNA3P51805 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLXNA3P51805 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA3P51805 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms