Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR4P51679 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCR4P51679 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR4P51679 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR4P51679 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR4P51679 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR4P51679 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR4P51679 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR4P51679 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR4P51679 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR4P51679 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCR4P51679 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR4P51679 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR4P51679 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR4P51679 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR4P51679 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCR4P51679 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR4P51679 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR4P51679 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR4P51679 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR4P51679 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCR4P51679 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR4P51679 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR4P51679 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR4P51679 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR4P51679 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR4P51679 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR4P51679 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCR4P51679 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR4P51679 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR4P51679 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR4P51679 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR4P51679 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR4P51679 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCR4P51679 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR4P51679 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR4P51679 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR4P51679 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR4P51679 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR4P51679 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR4P51679 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCR4P51679 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCR4P51679 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR4P51679 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR4P51679 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR4P51679 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR4P51679 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR4P51679 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR4P51679 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR4P51679 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCR4P51679 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR4P51679 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR4P51679 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR4P51679 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR4P51679 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR4P51679 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR4P51679 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCR4P51679 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR4P51679 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR4P51679 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCR4P51679 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR4P51679 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR4P51679 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR4P51679 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR4P51679 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR4P51679 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR4P51679 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR4P51679 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR4P51679 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR4P51679 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCR4P51679 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR4P51679 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR4P51679 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR4P51679 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR4P51679 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR4P51679 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR4P51679 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR4P51679 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR4P51679 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCR4P51679 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR4P51679 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR4P51679 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR4P51679 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCR4P51679 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR4P51679 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR4P51679 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR4P51679 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR4P51679 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR4P51679 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR4P51679 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR4P51679 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR4P51679 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCR4P51679 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR4P51679 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR4P51679 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR4P51679 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR4P51679 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR4P51679 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR4P51679 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR4P51679 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms