Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBP50607 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBP50607 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBP50607 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBP50607 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBP50607 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBP50607 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBP50607 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBP50607 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBP50607 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBP50607 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBP50607 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBP50607 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBP50607 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBP50607 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBP50607 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBP50607 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBP50607 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBP50607 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBP50607 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBP50607 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBP50607 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBP50607 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBP50607 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBP50607 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBP50607 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBP50607 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBP50607 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBP50607 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBP50607 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBP50607 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBP50607 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBP50607 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBP50607 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBP50607 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBP50607 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBP50607 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBP50607 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBP50607 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBP50607 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBP50607 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBP50607 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBP50607 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBP50607 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBP50607 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBP50607 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBP50607 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBP50607 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBP50607 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBP50607 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBP50607 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBP50607 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBP50607 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBP50607 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBP50607 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBP50607 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBP50607 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBP50607 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBP50607 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBP50607 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBP50607 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBP50607 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBP50607 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBP50607 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBP50607 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBP50607 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TUBP50607 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBP50607 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBP50607 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBP50607 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBP50607 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBP50607 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBP50607 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBP50607 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBP50607 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBP50607 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBP50607 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBP50607 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBP50607 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBP50607 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBP50607 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBP50607 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBP50607 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBP50607 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBP50607 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBP50607 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBP50607 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBP50607 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBP50607 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBP50607 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBP50607 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBP50607 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBP50607 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBP50607 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBP50607 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBP50607 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBP50607 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBP50607 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBP50607 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBP50607 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms