Protein–RNA interactions for Protein: P50552

VASP, Vasodilator-stimulated phosphoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASPP50552 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VASPP50552 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VASPP50552 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VASPP50552 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VASPP50552 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VASPP50552 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VASPP50552 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VASPP50552 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VASPP50552 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VASPP50552 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VASPP50552 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VASPP50552 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VASPP50552 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VASPP50552 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VASPP50552 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VASPP50552 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VASPP50552 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VASPP50552 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VASPP50552 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VASPP50552 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VASPP50552 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VASPP50552 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VASPP50552 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VASPP50552 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VASPP50552 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VASPP50552 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VASPP50552 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VASPP50552 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VASPP50552 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VASPP50552 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VASPP50552 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VASPP50552 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VASPP50552 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VASPP50552 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VASPP50552 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VASPP50552 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VASPP50552 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VASPP50552 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VASPP50552 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VASPP50552 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VASPP50552 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VASPP50552 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VASPP50552 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VASPP50552 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VASPP50552 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VASPP50552 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VASPP50552 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VASPP50552 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VASPP50552 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VASPP50552 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VASPP50552 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VASPP50552 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VASPP50552 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VASPP50552 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VASPP50552 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VASPP50552 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VASPP50552 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VASPP50552 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VASPP50552 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VASPP50552 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VASPP50552 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VASPP50552 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VASPP50552 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VASPP50552 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VASPP50552 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VASPP50552 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VASPP50552 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VASPP50552 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VASPP50552 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VASPP50552 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VASPP50552 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VASPP50552 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VASPP50552 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VASPP50552 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VASPP50552 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VASPP50552 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VASPP50552 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VASPP50552 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VASPP50552 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VASPP50552 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VASPP50552 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VASPP50552 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VASPP50552 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VASPP50552 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VASPP50552 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VASPP50552 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VASPP50552 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VASPP50552 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VASPP50552 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VASPP50552 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VASPP50552 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VASPP50552 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VASPP50552 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VASPP50552 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VASPP50552 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VASPP50552 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VASPP50552 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VASPP50552 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VASPP50552 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VASPP50552 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms