Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HARS2P49590 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HARS2P49590 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HARS2P49590 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HARS2P49590 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HARS2P49590 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HARS2P49590 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARS2P49590 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARS2P49590 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARS2P49590 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARS2P49590 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HARS2P49590 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARS2P49590 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARS2P49590 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARS2P49590 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARS2P49590 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARS2P49590 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HARS2P49590 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HARS2P49590 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HARS2P49590 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HARS2P49590 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HARS2P49590 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HARS2P49590 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HARS2P49590 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HARS2P49590 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HARS2P49590 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HARS2P49590 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HARS2P49590 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HARS2P49590 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARS2P49590 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARS2P49590 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARS2P49590 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HARS2P49590 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARS2P49590 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARS2P49590 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARS2P49590 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARS2P49590 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARS2P49590 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARS2P49590 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARS2P49590 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARS2P49590 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARS2P49590 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARS2P49590 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARS2P49590 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARS2P49590 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARS2P49590 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HARS2P49590 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HARS2P49590 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HARS2P49590 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HARS2P49590 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HARS2P49590 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HARS2P49590 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HARS2P49590 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HARS2P49590 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HARS2P49590 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HARS2P49590 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HARS2P49590 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HARS2P49590 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HARS2P49590 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HARS2P49590 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HARS2P49590 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HARS2P49590 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HARS2P49590 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HARS2P49590 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HARS2P49590 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HARS2P49590 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HARS2P49590 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARS2P49590 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARS2P49590 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARS2P49590 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARS2P49590 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARS2P49590 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARS2P49590 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARS2P49590 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARS2P49590 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HARS2P49590 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARS2P49590 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARS2P49590 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARS2P49590 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARS2P49590 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARS2P49590 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARS2P49590 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARS2P49590 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARS2P49590 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARS2P49590 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARS2P49590 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HARS2P49590 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HARS2P49590 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HARS2P49590 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HARS2P49590 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HARS2P49590 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HARS2P49590 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HARS2P49590 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HARS2P49590 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HARS2P49590 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HARS2P49590 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HARS2P49590 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HARS2P49590 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARS2P49590 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARS2P49590 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms