Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRA4P48169 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABRA4P48169 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABRA4P48169 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRA4P48169 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms