Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP3P42574 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP3P42574 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP3P42574 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP3P42574 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP3P42574 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP3P42574 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP3P42574 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP3P42574 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP3P42574 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP3P42574 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP3P42574 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP3P42574 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP3P42574 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP3P42574 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP3P42574 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP3P42574 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP3P42574 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP3P42574 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP3P42574 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP3P42574 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP3P42574 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP3P42574 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP3P42574 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP3P42574 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP3P42574 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP3P42574 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP3P42574 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP3P42574 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP3P42574 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP3P42574 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP3P42574 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP3P42574 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP3P42574 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP3P42574 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP3P42574 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP3P42574 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP3P42574 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP3P42574 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP3P42574 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP3P42574 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP3P42574 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP3P42574 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP3P42574 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP3P42574 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP3P42574 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP3P42574 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP3P42574 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP3P42574 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP3P42574 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP3P42574 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP3P42574 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP3P42574 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP3P42574 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP3P42574 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP3P42574 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP3P42574 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP3P42574 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP3P42574 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP3P42574 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP3P42574 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP3P42574 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP3P42574 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP3P42574 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP3P42574 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP3P42574 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP3P42574 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP3P42574 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP3P42574 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP3P42574 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP3P42574 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP3P42574 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP3P42574 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP3P42574 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP3P42574 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP3P42574 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP3P42574 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP3P42574 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP3P42574 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP3P42574 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP3P42574 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP3P42574 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP3P42574 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP3P42574 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP3P42574 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP3P42574 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP3P42574 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP3P42574 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP3P42574 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP3P42574 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP3P42574 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP3P42574 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP3P42574 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP3P42574 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP3P42574 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP3P42574 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP3P42574 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP3P42574 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP3P42574 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP3P42574 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms