Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARL4AP40617 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARL4AP40617 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARL4AP40617 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms