Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA7P36544 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA7P36544 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHRNA7P36544 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms