Protein–RNA interactions for Protein: P34059

GALNS, N-acetylgalactosamine-6-sulfatase, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNSP34059 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALNSP34059 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALNSP34059 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALNSP34059 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALNSP34059 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALNSP34059 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALNSP34059 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALNSP34059 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GALNSP34059 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALNSP34059 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALNSP34059 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALNSP34059 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALNSP34059 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GALNSP34059 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALNSP34059 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALNSP34059 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALNSP34059 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GALNSP34059 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALNSP34059 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALNSP34059 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GALNSP34059 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GALNSP34059 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GALNSP34059 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALNSP34059 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALNSP34059 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALNSP34059 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALNSP34059 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALNSP34059 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALNSP34059 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GALNSP34059 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GALNSP34059 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALNSP34059 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALNSP34059 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALNSP34059 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GALNSP34059 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GALNSP34059 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALNSP34059 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALNSP34059 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALNSP34059 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALNSP34059 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALNSP34059 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GALNSP34059 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GALNSP34059 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GALNSP34059 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GALNSP34059 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GALNSP34059 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GALNSP34059 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALNSP34059 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALNSP34059 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALNSP34059 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALNSP34059 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALNSP34059 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALNSP34059 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALNSP34059 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALNSP34059 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALNSP34059 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GALNSP34059 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GALNSP34059 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GALNSP34059 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GALNSP34059 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GALNSP34059 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GALNSP34059 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GALNSP34059 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GALNSP34059 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GALNSP34059 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GALNSP34059 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GALNSP34059 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GALNSP34059 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALNSP34059 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALNSP34059 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALNSP34059 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GALNSP34059 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GALNSP34059 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALNSP34059 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALNSP34059 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALNSP34059 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALNSP34059 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GALNSP34059 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GALNSP34059 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GALNSP34059 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALNSP34059 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALNSP34059 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALNSP34059 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALNSP34059 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GALNSP34059 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GALNSP34059 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GALNSP34059 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GALNSP34059 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GALNSP34059 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALNSP34059 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALNSP34059 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALNSP34059 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALNSP34059 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALNSP34059 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALNSP34059 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALNSP34059 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GALNSP34059 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GALNSP34059 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GALNSP34059 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GALNSP34059 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms