Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB6P28072 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB6P28072 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB6P28072 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB6P28072 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB6P28072 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMB6P28072 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMB6P28072 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB6P28072 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms