Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 PEX5-202ENST00000266564 3170 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DCTD-212ENST00000510307 592 ntTSL 410.03□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GPATCH8-202ENST00000585614 686 ntTSL 310.03□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.815e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.815e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PLEKHA7-210ENST00000530489 3688 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TMEM260-211ENST00000556648 2013 ntTSL 29.94□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF7-215ENST00000519447 553 ntTSL 49.93□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MT1X-201ENST00000394485 450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.827e-8■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MDH1-209ENST00000462944 634 ntTSL 39.9□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.835e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MDH1-205ENST00000432309 844 ntTSL 59.82□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.855e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.855e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.864e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 THBS1-206ENST00000497720 527 ntTSL 29.66□□□□□ -0.865e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TRPV1-207ENST00000572705 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.865e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CD164-202ENST00000310786 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.873e-10■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GTF2A1-204ENST00000556268 864 ntTSL 59.62□□□□□ -0.875e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GPATCH8-205ENST00000587228 4713 ntTSL 1 (best)9.61□□□□□ -0.875e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MDH1-201ENST00000233114 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.875e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MT1X-203ENST00000564974 549 ntTSL 1 (best)9.55□□□□□ -0.887e-8■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TRPV1-202ENST00000399756 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MSANTD4-202ENST00000529805 1008 ntTSL 39.53□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AL669831.3-207ENST00000635509 941 ntTSL 59.44□□□□□ -0.98e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TRPV1-203ENST00000399759 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 STAU1-207ENST00000371856 3684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.96e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.915e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DCTD-204ENST00000503182 578 ntTSL 49.33□□□□□ -0.925e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.945e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SERPINA5-213ENST00000557598 607 ntTSL 29.14□□□□□ -0.955e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 COA1-204ENST00000415076 1737 ntTSL 39.02□□□□□ -0.964e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ACTR10-203ENST00000553907 780 ntTSL 38.85□□□□□ -0.995e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -13e-10■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CTAGE5-205ENST00000348007 2762 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.014e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.015e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF7-202ENST00000378560 2929 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.035e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CD164-201ENST00000275080 2954 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.063e-10■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.065e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SETDB1-213ENST00000498193 3854 ntTSL 28.39□□□□□ -1.075e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TMEM43-201ENST00000306077 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.085e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NR1I2-203ENST00000466380 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.085e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 HEG1-205ENST00000487661 3973 ntTSL 1 (best)8.31□□□□□ -1.085e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF7-216ENST00000520652 651 ntTSL 38.23□□□□□ -1.095e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PLEKHA7-203ENST00000525049 563 ntTSL 48.22□□□□□ -1.095e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF7-221ENST00000522375 557 ntTSL 48.08□□□□□ -1.125e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.135e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 COA1-210ENST00000446330 1520 ntTSL 27.98□□□□□ -1.134e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 COA1-211ENST00000446564 1177 ntTSL 27.91□□□□□ -1.144e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CTNNBL1-207ENST00000473857 2990 ntTSL 27.85□□□□□ -1.155e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MDH1-210ENST00000472098 936 ntTSL 1 (best)7.79□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 STX1A-207ENST00000470878 827 ntTSL 37.79□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PLEKHA7-205ENST00000525581 539 ntTSL 47.76□□□□□ -1.175e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.25e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.215e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PAH-213ENST00000551988 584 ntTSL 37.51□□□□□ -1.215e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MDH1-206ENST00000436321 680 ntTSL 37.27□□□□□ -1.255e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.275e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.275e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DNAJB11-204ENST00000495390 4079 ntTSL 26.98□□□□□ -1.296e-13■■■■■ 46.6
DDX6P26196 KIAA0753-205ENST00000571642 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 46.87□□□□□ -1.315e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C11orf58-205ENST00000525106 549 ntTSL 26.78□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ACTR10-205ENST00000554642 687 ntTSL 36.76□□□□□ -1.335e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PAH-207ENST00000549111 1252 ntTSL 1 (best)6.44□□□□□ -1.385e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SETDB1-204ENST00000368964 548 ntTSL 56.42□□□□□ -1.385e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 EIF5-213ENST00000560200 776 ntTSL 56.3□□□□□ -1.45e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MDH1-208ENST00000454035 575 ntTSL 36.23□□□□□ -1.415e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GPATCH8-207ENST00000590041 829 ntTSL 56.2□□□□□ -1.425e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SUCO-207ENST00000608804 868 ntTSL 36.17□□□□□ -1.425e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.444e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.454e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.465e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SETDB1-214ENST00000525956 587 ntTSL 45.89□□□□□ -1.475e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 IVD-204ENST00000481262 999 ntTSL 55.79□□□□□ -1.485e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NIPAL3-205ENST00000432012 2714 ntTSL 1 (best)5.66□□□□□ -1.55e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 IVD-201ENST00000466756 428 ntTSL 35.11□□□□□ -1.595e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 KIAA0753-203ENST00000570455 447 ntTSL 55.09□□□□□ -1.595e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ACTR10-216ENST00000557711 1584 ntTSL 1 (best)5.08□□□□□ -1.65e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CTAGE5-209ENST00000553383 1010 ntTSL 25.07□□□□□ -1.64e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.614e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TMEM260-210ENST00000556422 3864 ntTSL 1 (best)5□□□□□ -1.615e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MDH1-207ENST00000442225 785 ntTSL 54.97□□□□□ -1.615e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GPATCH8-210ENST00000592746 457 ntTSL 54.81□□□□□ -1.645e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SPTBN1-206ENST00000602898 2942 ntTSL 1 (best)4.74□□□□□ -1.655e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GPATCH8-203ENST00000586037 345 ntTSL 54.41□□□□□ -1.75e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MDH1-212ENST00000485155 571 ntTSL 1 (best)4.29□□□□□ -1.725e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 FBXO11-208ENST00000480038 600 ntTSL 44.09□□□□□ -1.755e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 FBXO11-204ENST00000424163 560 ntTSL 43.53□□□□□ -1.845e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CD164-206ENST00000499860 2845 ntTSL 1 (best)2.06□□□□□ -2.083e-10■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.64□□□□□ -2.155e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ANAPC11-209ENST00000573956 2136 nt18.31■□□□□ 0.524e-9■■■■■ 46.5
DDX6P26196 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.54e-9■■■■■ 46.5
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