Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDE6GP18545 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6GP18545 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6GP18545 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6GP18545 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6GP18545 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6GP18545 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDE6GP18545 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6GP18545 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6GP18545 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6GP18545 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6GP18545 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6GP18545 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6GP18545 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDE6GP18545 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6GP18545 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6GP18545 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6GP18545 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6GP18545 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6GP18545 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6GP18545 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6GP18545 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6GP18545 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6GP18545 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6GP18545 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDE6GP18545 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDE6GP18545 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6GP18545 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6GP18545 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6GP18545 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PDE6GP18545 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PDE6GP18545 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDE6GP18545 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6GP18545 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6GP18545 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6GP18545 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6GP18545 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6GP18545 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6GP18545 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6GP18545 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6GP18545 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6GP18545 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDE6GP18545 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDE6GP18545 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDE6GP18545 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDE6GP18545 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PDE6GP18545 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDE6GP18545 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PDE6GP18545 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDE6GP18545 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDE6GP18545 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDE6GP18545 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDE6GP18545 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDE6GP18545 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDE6GP18545 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDE6GP18545 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PDE6GP18545 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PDE6GP18545 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PDE6GP18545 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms