Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB5P18084 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB5P18084 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ITGB5P18084 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB5P18084 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB5P18084 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB5P18084 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB5P18084 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB5P18084 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB5P18084 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB5P18084 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB5P18084 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB5P18084 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB5P18084 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB5P18084 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB5P18084 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB5P18084 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ITGB5P18084 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB5P18084 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB5P18084 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB5P18084 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB5P18084 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB5P18084 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB5P18084 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB5P18084 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB5P18084 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB5P18084 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB5P18084 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB5P18084 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB5P18084 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB5P18084 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ITGB5P18084 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB5P18084 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB5P18084 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB5P18084 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ITGB5P18084 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ITGB5P18084 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ITGB5P18084 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB5P18084 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1796.5 ms