Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAG1P15918 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAG1P15918 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAG1P15918 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAG1P15918 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAG1P15918 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAG1P15918 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RAG1P15918 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAG1P15918 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAG1P15918 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAG1P15918 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAG1P15918 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAG1P15918 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAG1P15918 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAG1P15918 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAG1P15918 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAG1P15918 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAG1P15918 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAG1P15918 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAG1P15918 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAG1P15918 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAG1P15918 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAG1P15918 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAG1P15918 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAG1P15918 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAG1P15918 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAG1P15918 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAG1P15918 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAG1P15918 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAG1P15918 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RAG1P15918 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RAG1P15918 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAG1P15918 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAG1P15918 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAG1P15918 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAG1P15918 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAG1P15918 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RAG1P15918 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RAG1P15918 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RAG1P15918 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAG1P15918 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAG1P15918 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAG1P15918 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAG1P15918 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAG1P15918 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RAG1P15918 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAG1P15918 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAG1P15918 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAG1P15918 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAG1P15918 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAG1P15918 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAG1P15918 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAG1P15918 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAG1P15918 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAG1P15918 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAG1P15918 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAG1P15918 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAG1P15918 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAG1P15918 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAG1P15918 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAG1P15918 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAG1P15918 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RAG1P15918 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAG1P15918 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RAG1P15918 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAG1P15918 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RAG1P15918 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAG1P15918 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAG1P15918 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAG1P15918 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAG1P15918 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAG1P15918 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RAG1P15918 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAG1P15918 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAG1P15918 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAG1P15918 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAG1P15918 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAG1P15918 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAG1P15918 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAG1P15918 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAG1P15918 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAG1P15918 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAG1P15918 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAG1P15918 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAG1P15918 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAG1P15918 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAG1P15918 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAG1P15918 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAG1P15918 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAG1P15918 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAG1P15918 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAG1P15918 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAG1P15918 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAG1P15918 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAG1P15918 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAG1P15918 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAG1P15918 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAG1P15918 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAG1P15918 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAG1P15918 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms