Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLC5A1P13866 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC5A1P13866 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SLC5A1P13866 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC5A1P13866 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms