Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT13P13646 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT13P13646 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT13P13646 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT13P13646 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT13P13646 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT13P13646 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT13P13646 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT13P13646 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT13P13646 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT13P13646 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT13P13646 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT13P13646 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT13P13646 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT13P13646 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT13P13646 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT13P13646 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT13P13646 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT13P13646 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT13P13646 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT13P13646 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT13P13646 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT13P13646 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT13P13646 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT13P13646 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT13P13646 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT13P13646 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT13P13646 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT13P13646 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT13P13646 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT13P13646 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT13P13646 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT13P13646 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT13P13646 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT13P13646 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT13P13646 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT13P13646 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT13P13646 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT13P13646 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT13P13646 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT13P13646 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT13P13646 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT13P13646 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT13P13646 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT13P13646 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT13P13646 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT13P13646 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT13P13646 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT13P13646 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT13P13646 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT13P13646 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT13P13646 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT13P13646 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT13P13646 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT13P13646 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT13P13646 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT13P13646 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT13P13646 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT13P13646 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT13P13646 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT13P13646 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT13P13646 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT13P13646 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT13P13646 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT13P13646 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT13P13646 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT13P13646 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT13P13646 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT13P13646 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT13P13646 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT13P13646 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT13P13646 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT13P13646 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT13P13646 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT13P13646 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT13P13646 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT13P13646 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT13P13646 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT13P13646 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT13P13646 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT13P13646 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT13P13646 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT13P13646 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT13P13646 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT13P13646 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT13P13646 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT13P13646 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT13P13646 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT13P13646 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT13P13646 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT13P13646 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT13P13646 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT13P13646 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT13P13646 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT13P13646 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT13P13646 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT13P13646 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT13P13646 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT13P13646 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT13P13646 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms