Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKBP12277 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKBP12277 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKBP12277 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKBP12277 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKBP12277 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKBP12277 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CKBP12277 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CKBP12277 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKBP12277 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CKBP12277 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKBP12277 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKBP12277 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKBP12277 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CKBP12277 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKBP12277 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKBP12277 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CKBP12277 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CKBP12277 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CKBP12277 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKBP12277 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKBP12277 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKBP12277 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKBP12277 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKBP12277 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKBP12277 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKBP12277 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKBP12277 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CKBP12277 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CKBP12277 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CKBP12277 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CKBP12277 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKBP12277 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKBP12277 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKBP12277 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CKBP12277 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKBP12277 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKBP12277 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKBP12277 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKBP12277 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKBP12277 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKBP12277 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CKBP12277 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKBP12277 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKBP12277 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CKBP12277 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKBP12277 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKBP12277 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKBP12277 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CKBP12277 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKBP12277 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CKBP12277 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKBP12277 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKBP12277 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CKBP12277 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKBP12277 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKBP12277 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKBP12277 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKBP12277 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKBP12277 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKBP12277 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKBP12277 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKBP12277 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKBP12277 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CKBP12277 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKBP12277 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKBP12277 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKBP12277 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKBP12277 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CKBP12277 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CKBP12277 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CKBP12277 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CKBP12277 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CKBP12277 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CKBP12277 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKBP12277 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CKBP12277 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKBP12277 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CKBP12277 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKBP12277 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKBP12277 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKBP12277 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKBP12277 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CKBP12277 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKBP12277 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CKBP12277 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKBP12277 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKBP12277 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKBP12277 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CKBP12277 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKBP12277 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CKBP12277 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKBP12277 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKBP12277 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKBP12277 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKBP12277 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKBP12277 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKBP12277 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CKBP12277 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CKBP12277 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms