Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
COL11A1P12107 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
COL11A1P12107 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL11A1P12107 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
COL11A1P12107 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL11A1P12107 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms