Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYP2C9P11712 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP2C9P11712 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP2C9P11712 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP2C9P11712 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms