Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CBSLP0DN79 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CBSLP0DN79 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CBSLP0DN79 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CBSLP0DN79 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms