Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A1P02730 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC4A1P02730 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A1P02730 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A1P02730 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.3 ms