Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRP01130 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRP01130 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRP01130 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRP01130 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRP01130 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDLRP01130 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRP01130 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDLRP01130 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRP01130 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRP01130 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRP01130 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRP01130 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRP01130 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRP01130 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDLRP01130 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRP01130 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRP01130 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRP01130 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDLRP01130 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRP01130 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRP01130 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRP01130 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRP01130 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRP01130 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRP01130 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRP01130 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRP01130 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRP01130 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDLRP01130 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRP01130 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRP01130 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRP01130 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDLRP01130 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRP01130 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRP01130 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRP01130 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRP01130 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRP01130 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRP01130 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRP01130 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRP01130 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRP01130 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRP01130 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRP01130 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDLRP01130 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRP01130 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRP01130 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRP01130 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRP01130 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRP01130 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRP01130 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRP01130 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDLRP01130 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRP01130 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRP01130 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRP01130 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRP01130 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRP01130 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRP01130 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRP01130 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRP01130 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDLRP01130 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRP01130 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDLRP01130 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRP01130 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRP01130 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRP01130 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRP01130 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDLRP01130 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRP01130 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRP01130 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRP01130 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRP01130 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LDLRP01130 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRP01130 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRP01130 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRP01130 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRP01130 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRP01130 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LDLRP01130 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRP01130 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRP01130 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRP01130 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRP01130 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRP01130 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRP01130 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRP01130 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LDLRP01130 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRP01130 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRP01130 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRP01130 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRP01130 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LDLRP01130 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LDLRP01130 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDLRP01130 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDLRP01130 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDLRP01130 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LDLRP01130 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LDLRP01130 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms