Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBX18O95935 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBX18O95935 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBX18O95935 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TBX18O95935 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TBX18O95935 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TBX18O95935 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TBX18O95935 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX18O95935 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX18O95935 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX18O95935 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX18O95935 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX18O95935 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX18O95935 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX18O95935 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TBX18O95935 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX18O95935 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX18O95935 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX18O95935 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX18O95935 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX18O95935 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX18O95935 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TBX18O95935 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TBX18O95935 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TBX18O95935 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TBX18O95935 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TBX18O95935 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TBX18O95935 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TBX18O95935 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TBX18O95935 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TBX18O95935 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TBX18O95935 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX18O95935 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX18O95935 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX18O95935 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX18O95935 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX18O95935 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX18O95935 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX18O95935 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX18O95935 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX18O95935 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX18O95935 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX18O95935 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX18O95935 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX18O95935 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX18O95935 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX18O95935 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX18O95935 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX18O95935 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX18O95935 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX18O95935 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX18O95935 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TBX18O95935 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TBX18O95935 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TBX18O95935 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBX18O95935 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBX18O95935 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBX18O95935 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBX18O95935 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBX18O95935 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBX18O95935 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX18O95935 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX18O95935 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX18O95935 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX18O95935 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX18O95935 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX18O95935 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX18O95935 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX18O95935 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX18O95935 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX18O95935 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX18O95935 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX18O95935 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX18O95935 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX18O95935 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX18O95935 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX18O95935 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBX18O95935 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBX18O95935 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBX18O95935 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBX18O95935 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX18O95935 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX18O95935 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX18O95935 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX18O95935 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX18O95935 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX18O95935 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX18O95935 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX18O95935 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBX18O95935 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBX18O95935 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBX18O95935 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX18O95935 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX18O95935 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX18O95935 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX18O95935 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX18O95935 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX18O95935 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX18O95935 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX18O95935 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms