Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF12O95522 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF12O95522 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF12O95522 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF12O95522 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms