Protein–RNA interactions for Protein: O95470

SGPL1, Sphingosine-1-phosphate lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPL1O95470 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGPL1O95470 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGPL1O95470 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGPL1O95470 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGPL1O95470 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGPL1O95470 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGPL1O95470 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SGPL1O95470 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SGPL1O95470 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SGPL1O95470 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SGPL1O95470 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SGPL1O95470 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGPL1O95470 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGPL1O95470 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGPL1O95470 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms