Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG12O94817 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG12O94817 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG12O94817 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG12O94817 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG12O94817 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG12O94817 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG12O94817 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG12O94817 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG12O94817 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG12O94817 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG12O94817 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG12O94817 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG12O94817 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG12O94817 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG12O94817 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG12O94817 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG12O94817 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG12O94817 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG12O94817 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG12O94817 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG12O94817 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG12O94817 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG12O94817 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG12O94817 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG12O94817 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG12O94817 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG12O94817 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG12O94817 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG12O94817 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG12O94817 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG12O94817 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG12O94817 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG12O94817 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG12O94817 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG12O94817 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG12O94817 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG12O94817 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG12O94817 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG12O94817 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG12O94817 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG12O94817 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG12O94817 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG12O94817 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG12O94817 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG12O94817 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG12O94817 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG12O94817 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG12O94817 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG12O94817 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG12O94817 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG12O94817 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG12O94817 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG12O94817 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG12O94817 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG12O94817 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG12O94817 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG12O94817 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG12O94817 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG12O94817 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG12O94817 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG12O94817 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG12O94817 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG12O94817 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG12O94817 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG12O94817 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG12O94817 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG12O94817 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG12O94817 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG12O94817 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG12O94817 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG12O94817 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG12O94817 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG12O94817 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG12O94817 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG12O94817 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG12O94817 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG12O94817 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG12O94817 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG12O94817 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG12O94817 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG12O94817 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG12O94817 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG12O94817 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG12O94817 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG12O94817 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG12O94817 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG12O94817 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG12O94817 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG12O94817 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG12O94817 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG12O94817 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG12O94817 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG12O94817 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG12O94817 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG12O94817 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG12O94817 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG12O94817 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG12O94817 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG12O94817 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms