Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASSF9O75901 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASSF9O75901 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RASSF9O75901 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms