Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PMPCBO75439 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PMPCBO75439 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMPCBO75439 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PMPCBO75439 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms