Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNG3O60359 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG3O60359 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG3O60359 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNG3O60359 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms