Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3O43889 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3O43889 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3O43889 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3O43889 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3O43889 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREB3O43889 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CREB3O43889 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3O43889 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3O43889 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3O43889 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3O43889 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREB3O43889 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3O43889 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3O43889 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3O43889 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3O43889 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3O43889 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREB3O43889 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3O43889 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREB3O43889 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3O43889 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3O43889 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3O43889 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3O43889 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREB3O43889 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB3O43889 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB3O43889 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB3O43889 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB3O43889 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREB3O43889 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3O43889 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3O43889 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3O43889 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3O43889 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREB3O43889 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3O43889 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3O43889 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3O43889 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3O43889 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3O43889 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREB3O43889 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CREB3O43889 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CREB3O43889 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CREB3O43889 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CREB3O43889 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CREB3O43889 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB3O43889 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB3O43889 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CREB3O43889 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3O43889 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3O43889 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3O43889 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3O43889 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3O43889 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3O43889 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3O43889 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3O43889 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB3O43889 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3O43889 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3O43889 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3O43889 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB3O43889 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3O43889 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3O43889 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB3O43889 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CREB3O43889 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CREB3O43889 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB3O43889 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB3O43889 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3O43889 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3O43889 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3O43889 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3O43889 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB3O43889 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3O43889 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3O43889 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3O43889 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3O43889 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3O43889 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3O43889 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB3O43889 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3O43889 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3O43889 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3O43889 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3O43889 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3O43889 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3O43889 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB3O43889 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3O43889 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3O43889 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3O43889 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3O43889 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3O43889 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3O43889 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3O43889 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB3O43889 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3O43889 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3O43889 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB3O43889 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms