Protein–RNA interactions for Protein: O43747

AP1G1, AP-1 complex subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1G1O43747 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP1G1O43747 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP1G1O43747 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP1G1O43747 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms