Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TREHO43280 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TREHO43280 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TREHO43280 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TREHO43280 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TREHO43280 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TREHO43280 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TREHO43280 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TREHO43280 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TREHO43280 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TREHO43280 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TREHO43280 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TREHO43280 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TREHO43280 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TREHO43280 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TREHO43280 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TREHO43280 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TREHO43280 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TREHO43280 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TREHO43280 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TREHO43280 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TREHO43280 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TREHO43280 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TREHO43280 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TREHO43280 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TREHO43280 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TREHO43280 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TREHO43280 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TREHO43280 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TREHO43280 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TREHO43280 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TREHO43280 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TREHO43280 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TREHO43280 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TREHO43280 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREHO43280 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREHO43280 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TREHO43280 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREHO43280 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREHO43280 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREHO43280 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TREHO43280 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TREHO43280 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TREHO43280 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TREHO43280 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TREHO43280 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TREHO43280 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TREHO43280 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TREHO43280 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TREHO43280 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREHO43280 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREHO43280 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREHO43280 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREHO43280 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREHO43280 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREHO43280 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREHO43280 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREHO43280 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TREHO43280 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TREHO43280 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TREHO43280 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TREHO43280 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TREHO43280 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TREHO43280 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TREHO43280 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TREHO43280 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TREHO43280 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TREHO43280 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TREHO43280 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TREHO43280 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TREHO43280 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TREHO43280 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TREHO43280 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TREHO43280 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TREHO43280 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TREHO43280 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TREHO43280 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TREHO43280 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TREHO43280 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TREHO43280 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TREHO43280 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TREHO43280 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TREHO43280 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TREHO43280 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TREHO43280 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TREHO43280 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TREHO43280 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TREHO43280 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TREHO43280 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TREHO43280 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TREHO43280 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TREHO43280 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TREHO43280 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TREHO43280 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREHO43280 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREHO43280 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREHO43280 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREHO43280 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREHO43280 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TREHO43280 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 287.3 ms