Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TREHO43280 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TREHO43280 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TREHO43280 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TREHO43280 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TREHO43280 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TREHO43280 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TREHO43280 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
TREHO43280 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TREHO43280 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TREHO43280 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TREHO43280 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TREHO43280 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TREHO43280 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TREHO43280 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TREHO43280 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TREHO43280 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TREHO43280 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TREHO43280 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TREHO43280 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TREHO43280 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TREHO43280 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TREHO43280 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TREHO43280 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TREHO43280 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TREHO43280 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TREHO43280 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TREHO43280 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TREHO43280 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TREHO43280 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TREHO43280 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TREHO43280 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TREHO43280 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TREHO43280 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TREHO43280 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TREHO43280 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TREHO43280 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
TREHO43280 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TREHO43280 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TREHO43280 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TREHO43280 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TREHO43280 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TREHO43280 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TREHO43280 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TREHO43280 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TREHO43280 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TREHO43280 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TREHO43280 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TREHO43280 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TREHO43280 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TREHO43280 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TREHO43280 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TREHO43280 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TREHO43280 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TREHO43280 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TREHO43280 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TREHO43280 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TREHO43280 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TREHO43280 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TREHO43280 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TREHO43280 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TREHO43280 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TREHO43280 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TREHO43280 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TREHO43280 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TREHO43280 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TREHO43280 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TREHO43280 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TREHO43280 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TREHO43280 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TREHO43280 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TREHO43280 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TREHO43280 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TREHO43280 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TREHO43280 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TREHO43280 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TREHO43280 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TREHO43280 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TREHO43280 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TREHO43280 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TREHO43280 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TREHO43280 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TREHO43280 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TREHO43280 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TREHO43280 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TREHO43280 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TREHO43280 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
TREHO43280 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TREHO43280 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TREHO43280 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TREHO43280 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TREHO43280 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TREHO43280 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TREHO43280 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TREHO43280 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TREHO43280 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TREHO43280 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TREHO43280 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
TREHO43280 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TREHO43280 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms