Protein–RNA interactions for Protein: O14519

CDK2AP1, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP1O14519 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK2AP1O14519 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK2AP1O14519 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK2AP1O14519 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK2AP1O14519 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK2AP1O14519 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK2AP1O14519 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK2AP1O14519 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK2AP1O14519 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK2AP1O14519 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK2AP1O14519 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK2AP1O14519 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2AP1O14519 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms