Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
O00370 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
O00370 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
O00370 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
O00370 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
O00370 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
O00370 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
O00370 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
O00370 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
O00370 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
O00370 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
O00370 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
O00370 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
O00370 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
O00370 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
O00370 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
O00370 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
O00370 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
O00370 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
O00370 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
O00370 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
O00370 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
O00370 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
O00370 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
O00370 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
O00370 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
O00370 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
O00370 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
O00370 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
O00370 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
O00370 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
O00370 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
O00370 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
O00370 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
O00370 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
O00370 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
O00370 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
O00370 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
O00370 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
O00370 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
O00370 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
O00370 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
O00370 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
O00370 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
O00370 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
O00370 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
O00370 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
O00370 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
O00370 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
O00370 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
O00370 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
O00370 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
O00370 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
O00370 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
O00370 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
O00370 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
O00370 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
O00370 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
O00370 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
O00370 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
O00370 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
O00370 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
O00370 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
O00370 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
O00370 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
O00370 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
O00370 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
O00370 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
O00370 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
O00370 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
O00370 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
O00370 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
O00370 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
O00370 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
O00370 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
O00370 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
O00370 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
O00370 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
O00370 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
O00370 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
O00370 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
O00370 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
O00370 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
O00370 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
O00370 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
O00370 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
O00370 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
O00370 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
O00370 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
O00370 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
O00370 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
O00370 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
O00370 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
O00370 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
O00370 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
O00370 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
O00370 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
O00370 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
O00370 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
O00370 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms