Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGRPO00253 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGRPO00253 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGRPO00253 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGRPO00253 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGRPO00253 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGRPO00253 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGRPO00253 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGRPO00253 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGRPO00253 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGRPO00253 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGRPO00253 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AGRPO00253 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGRPO00253 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGRPO00253 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGRPO00253 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGRPO00253 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGRPO00253 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AGRPO00253 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
AGRPO00253 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGRPO00253 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGRPO00253 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGRPO00253 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGRPO00253 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGRPO00253 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGRPO00253 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGRPO00253 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGRPO00253 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGRPO00253 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGRPO00253 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGRPO00253 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGRPO00253 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGRPO00253 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGRPO00253 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGRPO00253 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGRPO00253 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGRPO00253 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGRPO00253 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGRPO00253 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGRPO00253 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGRPO00253 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGRPO00253 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGRPO00253 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGRPO00253 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGRPO00253 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AGRPO00253 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGRPO00253 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGRPO00253 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGRPO00253 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGRPO00253 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AGRPO00253 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGRPO00253 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGRPO00253 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGRPO00253 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGRPO00253 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGRPO00253 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AGRPO00253 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AGRPO00253 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGRPO00253 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGRPO00253 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AGRPO00253 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGRPO00253 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGRPO00253 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGRPO00253 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AGRPO00253 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGRPO00253 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGRPO00253 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGRPO00253 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGRPO00253 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGRPO00253 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGRPO00253 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGRPO00253 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AGRPO00253 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGRPO00253 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGRPO00253 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AGRPO00253 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGRPO00253 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGRPO00253 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGRPO00253 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AGRPO00253 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGRPO00253 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AGRPO00253 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AGRPO00253 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGRPO00253 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AGRPO00253 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AGRPO00253 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGRPO00253 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGRPO00253 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGRPO00253 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AGRPO00253 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGRPO00253 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGRPO00253 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGRPO00253 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGRPO00253 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGRPO00253 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGRPO00253 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGRPO00253 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGRPO00253 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGRPO00253 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AGRPO00253 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms