Protein–RNA interactions for Protein: H0YCG3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H0YCG3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H0YCG3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H0YCG3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H0YCG3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H0YCG3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H0YCG3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H0YCG3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H0YCG3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H0YCG3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H0YCG3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H0YCG3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
H0YCG3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H0YCG3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H0YCG3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H0YCG3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H0YCG3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H0YCG3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H0YCG3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
H0YCG3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H0YCG3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H0YCG3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H0YCG3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
H0YCG3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
H0YCG3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
H0YCG3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H0YCG3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H0YCG3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
H0YCG3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
H0YCG3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
H0YCG3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
H0YCG3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H0YCG3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H0YCG3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
H0YCG3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H0YCG3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H0YCG3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H0YCG3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H0YCG3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
H0YCG3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H0YCG3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H0YCG3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H0YCG3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
H0YCG3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H0YCG3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H0YCG3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H0YCG3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H0YCG3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H0YCG3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H0YCG3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H0YCG3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
H0YCG3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H0YCG3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H0YCG3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H0YCG3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H0YCG3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H0YCG3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H0YCG3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
H0YCG3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H0YCG3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H0YCG3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H0YCG3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H0YCG3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H0YCG3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H0YCG3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H0YCG3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H0YCG3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H0YCG3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H0YCG3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H0YCG3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H0YCG3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H0YCG3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H0YCG3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H0YCG3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H0YCG3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H0YCG3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H0YCG3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H0YCG3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H0YCG3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
H0YCG3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H0YCG3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H0YCG3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H0YCG3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H0YCG3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H0YCG3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H0YCG3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H0YCG3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H0YCG3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
H0YCG3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H0YCG3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H0YCG3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H0YCG3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H0YCG3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H0YCG3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
H0YCG3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
H0YCG3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
H0YCG3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H0YCG3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H0YCG3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H0YCG3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H0YCG3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms