Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP17L12C9JPN9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP17L12C9JPN9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP17L12C9JPN9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP17L12C9JPN9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms