Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRRT4C9JH25 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRT4C9JH25 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRRT4C9JH25 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRRT4C9JH25 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms