Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB7

TMEM221, Transmembrane protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM221A6NGB7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM221A6NGB7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM221A6NGB7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM221A6NGB7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM221A6NGB7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM221A6NGB7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM221A6NGB7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM221A6NGB7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM221A6NGB7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM221A6NGB7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM221A6NGB7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM221A6NGB7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM221A6NGB7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM221A6NGB7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM221A6NGB7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM221A6NGB7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms