Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35F4A4IF30 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35F4A4IF30 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182 ms