Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LCHNA4D1U4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LCHNA4D1U4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCHNA4D1U4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LCHNA4D1U4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms