Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A0U1RQF3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
A0A0U1RQF3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0U1RQF3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0U1RQF3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms