Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX12Q9UMY4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms