Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FBXL12Q9NXK8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms