Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C1orf61-217ENST00000486517 726 ntTSL 316.81■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 APOO-205ENST00000633372 1159 ntTSL 316.81■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SSBP2-207ENST00000507472 582 ntTSL 316.8■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 G3BP2-206ENST00000503660 1071 ntTSL 516.78■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HMBS-208ENST00000536813 507 ntTSL 316.77■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MAEA-220ENST00000515766 3136 ntTSL 216.75■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CERS2-210ENST00000558062 896 ntTSL 216.74■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC013652.1-205ENST00000559318 552 ntTSL 416.74■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ACLY-208ENST00000590735 586 ntTSL 416.72■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.269e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.269e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMG9-205ENST00000597586 697 ntTSL 216.67■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.269e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.269e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.269e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.259e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.254e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MAEA-204ENST00000503162 2069 ntTSL 216.59■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EDC3-210ENST00000566219 688 ntTSL 316.59■□□□□ 0.259e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 WDR90-223ENST00000552728 3133 ntTSL 516.56■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MRVI1-212ENST00000532037 567 ntTSL 416.56■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TSNARE1-206ENST00000520462 589 ntTSL 416.49■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TXNDC15-208ENST00000508810 579 ntTSL 316.49■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CRYBG2-204ENST00000374211 691 ntTSL 316.49■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 BECN1-211ENST00000589636 561 ntTSL 416.48■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.234e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 E2F6-206ENST00000444832 3296 ntTSL 1 (best)16.45■□□□□ 0.229e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CRYBG2-203ENST00000374208 469 ntTSL 516.44■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATG7-205ENST00000419112 565 ntTSL 416.44■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HDHD3-203ENST00000485934 913 ntTSL 216.38■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0D1-207ENST00000563305 1656 ntTSL 516.37■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SEC22C-208ENST00000445388 823 ntTSL 516.37■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM199-203ENST00000483505 735 ntTSL 516.36■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DLK2-204ENST00000430324 1056 ntTSL 216.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DEF8-212ENST00000563805 992 ntTSL 316.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GABPB2-203ENST00000462520 1011 ntTSL 316.34■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.219e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CKMT1B-205ENST00000437534 2396 ntTSL 216.33■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ERCC2-210ENST00000587376 817 ntTSL 516.32■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-210ENST00000429978 586 ntTSL 416.29■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMTN-213ENST00000460658 5080 ntTSL 516.28■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM184B-208ENST00000466117 542 ntTSL 416.26■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.199e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C2-217ENST00000497706 1609 ntTSL 516.24■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMAD5-205ENST00000509297 854 ntTSL 1 (best)16.24■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FPGS-213ENST00000479147 816 ntTSL 516.22■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADA-202ENST00000464097 1770 ntTSL 216.21■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF142-207ENST00000450765 6028 ntTSL 1 (best)16.2■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARRB1-208ENST00000531012 1744 ntTSL 216.18■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADAM15-216ENST00000472434 2894 ntTSL 516.16■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CUL3-213ENST00000536702 404 ntTSL 316.16■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF142-204ENST00000440934 880 ntTSL 516.12■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMTN-219ENST00000493335 2937 ntTSL 216.1■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 IQCB1-203ENST00000393650 2253 ntTSL 516.09■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CUL9-211ENST00000506830 1978 ntTSL 1 (best)16.06■□□□□ 0.164e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADAM15-211ENST00000461564 2751 ntTSL 216.03■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SIGIRR-213ENST00000528209 933 ntTSL 316.03■□□□□ 0.162e-22■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.164e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CARS2-203ENST00000465145 748 ntTSL 516■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GABRB1-205ENST00000513567 576 ntTSL 415.99■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMG9-213ENST00000602222 650 ntTSL 415.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 149.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1538.2 ms