Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC22CQ9BRL7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SEC22CQ9BRL7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC22CQ9BRL7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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