Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms