Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PCID2Q5JVF3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms